Der Vorstand ist die gesetzliche Vertretung der Stiftung. Er ist verantwortlich für die Erfüllung des Stiftungszwecks sowie die ordnungsgemäße Bewirtschaftung des Stiftungskapitals. Der Vorstand der Waisenhausstiftung Siloah Isny im Allgäu besteht aus folgenden Personen ergänzt durch den Vertreter des Kuratoriums und der Geschäftsführung:
Michael Mitt
Vorstandsvorsitzender
Martin Diez
1. stellvertretender Vorstand
Rainer Magenreuter
2. Stellvertretender Vorstand
Walter Braun
Finanzvorstand
Dr. Dagmar Hoehne
Fachlicher Vorstand
N.N.
Geschäftsführung
Dr. Kurt Lillich
Vorsitzender des Kuratoriums